建筑与土木工程实验教学中心作为服务多专业的实验教学中心，为实现教学资源的共享和高效利用，中心实行主任负责制，由中心主任统筹安排、调配、使用实验教学资源，实现优质资源共享，统一组织开展实验教学、改革与建设、管理等各项工作。实验教学经费由学校下拨，实验教学方面的任务和要求由教务处与中心下达，学科建设和人员管理归属中心管理，形成了校院二级职责明晰并有机结合的二级管理体制与运行模式。